1996年，芜湖县面积940.6平方千米，人口52.4万，辖7镇17乡：湾沚镇、西河镇、荆山镇、清水镇、方村镇、石硊镇、火龙岗镇、黄池乡、赵桥乡、埭南乡、白马乡、陶辛乡、易太乡、政和乡、周皋乡、保丰乡、咸保乡、新丰乡、三元乡、红杨乡、六郎乡、和平乡、保沙乡、花桥乡、十连乡。县政府驻湾沚镇。
1997年，撤销红杨乡，设立红杨镇，镇人民政府驻红杨營街；销保丰乡，设立六郎镇，镇人民政府驻六郎；撤销易太乡，设立易太镇，镇人民政府驻殷港；撤销三元乡，设立三元镇，镇人民政府驻三元；撤销陶辛乡，设立陶辛镇，镇人民政府驻陶辛。
2000年第五次人口普查，全县总人口497564人，其中（17个镇、7个乡）：湾沚镇54452人，火龙岗镇32726人，清水镇67191人，荆山镇9777人，方村镇25577人，西河镇12102人，石硊镇26014人，陶辛镇21233人，易太镇23481人，周皋镇16475人，六郎镇17600人，咸保镇12662人，新丰镇12982人，花桥镇13963人，横岗镇21473人，红杨镇19023人，三元镇18114人，白马乡9195人，埭南乡11067人，十连乡10081人，保沙乡17139人，政和乡9690人，赵桥乡16968人，和平乡18579人。
2003年，芜湖县由24乡镇合并为8个镇，具体如下：原湾沚镇、新丰镇、赵桥乡、三元镇合并为湾沚镇；原清水镇、荆山镇合并为清水镇；原火龙岗镇、石硊镇、白马乡合并为火龙岗镇；原六郎镇、周皋镇、政和乡、易太镇、咸保镇合并为六郎镇；原陶辛镇、十连乡、保沙乡合并为陶辛镇；原方村镇、埭南乡合并为方村镇；原红杨镇、和平乡、西河镇合并为红杨镇；原花桥镇、横岗镇合并为花桥镇。2003年末，全县面积943平方千米，157451户、539193人。辖8镇：湾沚镇、清水镇、火龙岗镇、方村镇、陶辛镇、红杨镇、花桥镇、六郎镇，共有20个居委会、171个行政村。
2004年，根据《关于同意将芜湖县清水镇划入市区的批复》（民地字[2004]49号）：将芜湖县的清水镇划入芜湖市鸠江区。2004年底，芜湖县辖7个镇：湾沚镇、火龙岗镇、六郎镇、陶辛镇、方村镇、红杨镇、花桥镇。
2005年9月13日，国务院批准（国函[2005]77号）调整芜湖市部分行政区划：将芜湖县火龙岗镇划归弋江区管辖。2006年2月9日，芜湖市人民政府批准：将芜湖县原荆山镇区域划归镜湖区管辖，将火龙岗镇划归弋江区管辖，将清水镇（不含原荆山镇区域）划归鸠江区管辖。芜湖县面积由原来的943平方千米变为730平方千米，人口由53.43万减少到38.13万。.
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