使用Application Compatibility Tool很简单（界面见图）：
单击界面“Browse...”按钮，选择想要运行的程序，然后在“Operating System”栏中选择想要模拟的操作系统，随后单击“OK”即可。如果还是无法运行，那可以试试下面的三个复选项：
| Disable Heap Manager on Windows 2000 | 防止程序与Windows 2000的内存管理模式发生冲突 |
| Use pre－Windows 2000 Temp path | 用于禁用Windows 2000的临时目录 |
| Correct disk space detection for 2－GB＋ drives | 防止程序与Windows 2000磁盘空间检测发生冲突 |
如果通过上述方法，程序在Windows 2000中得以正常运行，那可以选中“Make the above check box settings permanent”该选项，以便将有关信息写入注册表，这样以后就不需要每次都运行“Application Compatibility Tool”了。
不过并非所有与Windows 2000不兼容的程序都能通过此法解决，因为毕竟很多程序不光需要操作系统的支持，还牵涉到很多动态连接库，这些可是没法模拟出来的。